據報導，郭飛熊星期三(8日)下午四點到達新華門。北京異見人士齊志勇約四點半趕到新華門支援郭飛熊時，郭已不在現場。不過，現場警察無意中證實了郭飛熊被抓的消息。

齊志勇說，「找到那兒，看到那兒有兩輛車在那兒，我一走上去，可能晚了一步，車上已經塞滿人了，警察就強行把門給關上了，那個時候大概四點半左右吧。那警察說 『你找那個郭什麼熊的麼？已經來了6個人了，你找不着他啦！』喔！這一下我就等於把事情了解了一下。那警察說『你想見他幹嘛？』我說『我沒說想見』。他說 『你怎沒說呀！你走不了了！你是重點人，我告訴你！』拿着我的證件和身分證就開始往上報。在這時候陸續的有來往的上訪的，只要是3個、5個的過來的，全給扣住，全給往車上抓。到後來他們把我押回到我家裏。」

被抓後，郭飛熊間斷地與外界通電話，表示自己被帶到了府右街派出所。但六點後電話就無法再接通。

對於被抓，郭飛熊早有預料，他在星期三中午發給記者的電郵裏寫道：「我正前往中央政府所在地新華門，請在北京時間今日下午3點半之前，不要發表或引用下述文件內容。過了此一時間，大家不妨引用，不必與我本人聯繫上。因爲我估計到時候我已失去自由。」

郵件還附有他給中共政權領導人胡錦濤和溫家寶的和平請願書，裏面就政府在幾件事件中採取的做法提出抗議，包括汕尾槍殺事件，官黑一家打壓太石村村民罷選，廣州大學城強行徵地事件，暴力傷害維權者，以及關閉《冰點》週刊和《燕南網》。請願書還要求中共領導人及早啓動政治改革，放開新聞自由和基層選舉。

郭飛熊對胡溫寫道，如果兩位「認爲我的請願和絕食行爲違背了相關法律，我願意承擔被拘留、被判刑的處罰。」但我事先聲明，促使我採取這一直接的微型抗爭的責任在於中央政權本身。不管我遭受到怎樣的處罰，我都提請兩位和中共各級政權「正視我的上述抗議和要求中所包含的普遍民意和內在價值。」

報導分析，在向外表示將要前往新華門之前，郭飛熊曾失蹤三天，估計他是爲了能夠成功擺脫跟蹤，前往北京。