中新社报导，徐建国在北京召开的「二００三年防治SARS学术研讨会」上列出的新发传染病名单包括：肠出血性大肠杆菌Ｏ１５７、Ｈ７感染，０１３９霍乱（血清群霍乱弧菌），军团菌，空肠弯曲菌腹泻，莱姆病，单核细胞李司特氏菌食物中毒，小肠结肠炎耶尔森氏菌感染，人类克雅氏病，多种病毒性脑炎，肾型出血热，肺炎衣原体感染，新型肝炎，小隐孢子虫腹泻，猫抓病等。

他表示，目前中国的现状是可能还存在著一些其他新发传染病，但没有分离到病原体；对一部分新发传染病还没有开展调查研究工作。而新发传染病具有不确定性，依靠目前的科技水平，不能预测何时何地会发生何种新发传染病，无法做好特异性的准备。因此，新发传染病不仅是中国也是世界性的重大公共卫生问题。

他分析说，新发传染病的发生与生物进化和社会、环境因素有关。微生物进化是导致出现新的病原体的内在因素。

徐建国指出，人口流动、人的行为方式、生态环境的改变、气候变暖、食品集中供应、免疫受损人群和社会交流的增多等社会因素，也为新传染病的发生提供了重要条件。研究发现，细菌可以在短时间发生大片段基因的获得和缺失，产生许多新的突变，其中有一部分可能成为新的病原菌。细菌还可能通过部分基因缺失，增强生命力，由弱毒菌变为强毒菌。微生物这种基因变化的机制，迫使人类不得不面对新的传染病。