吴官正在报告中多次强调“三个代表”的重要性，但暗中指出，在江泽民任中共总书记期间，全国“反腐败”斗争存在严重问题。

吴官正认为，十多年来，以江泽民同志为核心的前届党中央在“反腐倡廉”问题上做得还远远不够，并指出那只不过是仅仅「初步探索出一条适合我国现阶段基本国情的有效开展反腐倡廉的路子」，因此，「进入新世纪新阶段，党风廉政建设和反腐败斗争的任务艰巨而繁重」。吴官正紧接着强调，「各级党委和纪委一定要增强忧患意识，居安思危，清醒地认识到腐败现象的极端危害性，清醒地认识到反腐败斗争的长期性、艰巨性和复杂性，进一步增强政治责任感和工作紧迫感，更好地担负起反腐倡廉的历史使命。」

吴官正还认为，江泽民的“反腐败”没能使人民大众深受其益。因此，吴在报告中途强调“三个代表”的重要性时，突然话锋一转强调说，要紧紧围绕发展新任总书记胡锦涛提出的“执政兴国”的这个第一要务，「坚决贯彻党要管党、从严治党的方针，坚持标本兼治、综合治理，逐步加大治本的力度，把反腐倡廉工作提高到新水平，使人民群众更多地得到改革开放和现代化建设带来的实惠，更多地感受到加强党风廉政建设和深入开展反腐败斗争的成果，为实现全面建设小康社会的奋斗目标和战略任务提供坚强的政治保证。 」

对过去党内不民主现象严重，吴官正似乎也颇有感触，吴官正强调，要根据发展变化的新形势和新情况，「创新体制机制制度，推进从源头上预防和治理腐败的工作；健全制约监督机制，强化对党员领导干部的监督，不断取得党风廉政建设和反腐败工作新的阶段性成效。」