虽然有关李少民先生的去留前途争论将告一段落，但这次事件的影响肯定会持续一段长时间，因为李少民事件已为「一国两制」政策竖立了一个极重要的案例，说明即使出现涉及国家利益如间谍之类的案件，香港的执法当局、法院也可以自行处理，不需受内地法院的判例、控罪所约束。

　　香港与内地的两制绝不只是行政区域的分界、也不仅是社会制度的分界、更是两个有独立司法管辖权的区域。只要涉及的案件不关乎国防及外交，香港的执法当局及法院将有绝对的管辖权，不需受中央政府或内地其他机构掣肘，这将大大强化香港实行高度自治的框架，也将增强市民以至国际社会对一国两制政策的信心。

　　有的意见认为，李少民获准回港只是中美政治交易的一部分，因此只能是一个个别的例子，在未来遇上类似的情况时，特区政府的处理便可能有所不同。我们不同意这样的观点。尽管李少民事件为香港带来正面的影响，但事件对中国的影响则非常负面。一方面因案件完全是黑箱作业，外界对详情一无所知，加上中国政府对判为「间谍」的「犯人」宽松处理，只会让人感到这是另一次莫须有的拘捕及审判，这将进一步削弱中国法院及法律制度的公信力。