鄭有軍衝進店內後，即手持一把利刀抵住黃菊華的背，告訴她自己身上綁有炸彈，逼其打一一○報警電話，並聲稱自己受到迫害，有很多冤情，要求當局解決。他並威脅說，如不滿足其要求，將引爆炸彈同歸於盡。西客站的值班警察發現鄭有軍身綁炸彈，一手持刀，一手握引信，也不敢貿然採取行動。

凌晨一時十五分，北京鐵路公安局刑偵大隊一百多名刑警趕到後，立即包圍現場，北京市公安局急調防暴支隊增援，武警北京總隊亦派出特警狙擊手到現場待命。警方先將火車站東西出口封鎖，並疏散所有在候車大廳裏和西客站周圍的羣衆。當局出動了二十五部警車，六部救護車，以及八部消防車在現場戒備。北京市市委副書記、市公安局長強衛親赴現場指揮。

雖然警方不斷以擴音器勸喻挾持人質的鄭有軍投降，但鄭依然情緒激動，並不時作出要引爆炸彈的動作，令警方心驚。警方一度考慮使用特警神槍手將其擊斃，但警方高層認爲萬一被其引爆炸彈，後果不堪設想，爲慎重起見，警方決定繼續與其周旋。

直至13日上午七時許，警方派出二男一女談判專家到場與鄭有軍對話，其中主談的女談判專家非常誠懇地勸鄭有軍，有什麼冤情儘管說，北京警方會幫其投訴，並耐心聽其申訴，同時要求鄭有軍和人質一起步出店外商談，並稱政府會派人來聽取他的投訴。鄭有軍果然押□人質出來，在西客站北出口繼續與警方對峙。女談判專家又介紹兩名特警喬扮的政府官員接近了鄭有軍。

上午九時三十分左右，鄭有軍因疲憊及談話較多，漸漸分神，女談判專家在分散鄭有軍注意力後，乘其不備，突然拉開人質黃菊華，此時兩名特警迅速撲上去將鄭有軍壓在地上，反剪雙手。警方炸彈專家也立刻上前拆除其身上的炸彈。兩名特警在扭打過程中被鄭有軍用刀刺傷，鄭有軍本人亦受輕傷。目前，此案仍在進一步偵辦中。

觀察家認爲，聲稱自己受到迫害，有很多冤情，要求當局解決的鄭有軍被稱作歹徒還爲時過早，如果不到實在活不下去的時候，誰都會珍惜自己的生命。他劫持人質的手法固然不可取，可是從近日媒體報導的「越級上訪」就是犯罪看來，從中共「嚴打」把不該殺的殺掉看來，中共沒有任何法律約束，它就是法，這就造成中共的各層土皇帝不允許百姓伸冤，百姓實際上成了共產奴隸。制服了一個鄭有軍，中共治下還有十三億，怎麼辦？！